PhD Student (E13 TV-GU, 50%), starting preferably 01.08.2018

PhD Student (E13 TV-GU, 50%), starting date at the soonest possible

The Department for Applied Bioinformatics in the Institute for Cell Biology and Neuroscience, faculty for biosciences, Goethe-university Frankfurt, is looking for one highly motivated 

PhD Student
(E13 TV-GU, half-time) 

to complement its research staff. The position will be available initially for three years with the option of extension, starting preferably 01.08.2018. 

The Team: The Applied Bioinformatics Group is interested in topics circling around the evolution of biological sequences and of their functions. Thematically, we cover a broad spectrum that ranges from the modelling of sequence evolution, via the development of algorithms and methods applied in the homology search and the reconstruction of sequence and species tree, up to comparative genomics and the functional annotation transfer between sequences from model- and non-model organisms. Our overarching aim to reconstruct how functional protein interaction networks evolve and how this relates to the characteristics of contemporary species. We perform analyses using data from various taxonomic groups spread across the three domains of life (Bacteria, Archaea, Eukaryotes). 

The Position: We are looking for motivated people with a general interest in biological sequence analysis. Depending on the background of the candidate, possible research topics come from the areas of statistical modelling, algorithms and software development, and/or the applied analysis of x-omics data. You are invited to contribute to already ongoing projects, but we highly welcome ideas that lead to the joint design of new research topics. To complement your research activities, you will participate in the undergraduate and graduate teaching (2 LVS). This will give you the chance to recruit students to support you in your research project.

There is room for independent research, especially working on a doctoral thesis. 

What we expect: You have at least a university degree (MSc. or equivalent) in Bioinformatics, Computer Science, Molecular-/Systems-Biology, Mathematics/Statistics, Physics, or a related field. We expect very good programming skills in at least one of the following languages: Java, Python, Perl, C, C++, or R. Experiences in the handling and analysis of high throughput sequencing data is a plus. We expect strong communication skills and the ability to work in a team. Very good knowledge in written and spoken English are a pre-requisite. 

You will find further details about our group at http://www.Bio.Uni-Frankfurt.de/43045195/AK-Ebersberger 

Please direct your application together with a motivation letter, your CV, and the usual documents (including to letters of recommendation) as a PDF file until July 17^th 2018 to Prof. Dr. Ingo Ebersberger, Institut für Zellbiologie und Neurowissenschaften, Abt. für Angewandte Bioinformatik, Max-von-Laue-Straße 13, 60438 Frankfurt am Main, e-Mail: haenel@bio.uni-frankfurt.de.

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Am Institut für Zellbiologie und Neurowissenschaft, in der Abteilung für Angewandte Bioinformatik, des Fachbereichs Biowissenschaften der Goethe-Universität Frankfurt ist die Stelle einer/eines 

Wissenschaftlichen Mitarbeiterin/Mitarbeiters
(E13 TV-G-U, halbtags) 

zu besetzen. Die Stelle ist für 3 Jahre mit der Möglichkeit auf Verlängerung zu besetzen. Der Einstellungstermin ist zum 01.08.2018. 

Der Arbeitskreis für Angewandte Bioinformatik beschäftigt sich mit Forschungsthemen rund um die Evolution von biologischen Sequenzen und deren Funktion. Hierbei decken wir ein breites Spektrum ab, das von der Modellierung von Sequenzevolution, über die Entwicklung von Algorithmen und Methoden in der Homologen-Suche und die Rekonstruktion von Sequenz- und Speziesbäumen bis hin zu vergleichenden Genomanalysen und dem funktionellen Annotationstransfer zwischen Modell- und nicht-Modell-Organismen reicht. Unser übergeordnetes Ziel ist es, die Evolution von funktionellen Protein-Interaktionsnetzwerken zu rekonstruieren und mit den Charakteristika der heute existierenden Arten zu verbinden. Wir führen diese Analysen anhand von Daten unterschiedlicher Organismengruppen durch, die sich aus allen drei Domänen des Lebens (Bakterien, Archaea, Eukaryoten) rekrutieren. 

Wir suchen für die Erweiterung unserer Gruppe eine motivierte Persönlichkeit mit einem Interessensschwerpunkt in der biologischen Sequenzanalyse. Mögliche Arbeitsthemen können sich, je nach Vorbildung, aus dem Bereich der statistischen Modellierung, der Algorithmen- und Software-Entwicklung, und/oder aus der angewandten bioinformatischen Analyse von x-omics Daten rekrutieren. Sie haben die Möglichkeit, zu laufenden Projekten beizutragen, die gemeinsame Entwicklung neuer Forschungsthemen ist jedoch ausdrücklich erwünscht. Im Rahmen einer Beteiligung an der Lehre in einer Höhe von 2 LVS haben Sie die Möglichkeit Lehrerfahrung zu sammeln und Studierende für Ihr Forschungsprojekt zu begeistern. Es wird Gelegenheit zu selbstbestimmter Forschung gegeben. 

Voraussetzungen: Sie haben mindestens ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (MSc. oder vergleichbar) in Bioinformatik, Informatik, Molekular-/Systembiologie, Mathematik/Statistik, Physik oder in einem verwandten Feld. Wir erwarten sehr gute Programmierkenntnisse in mindestens einer der folgenden Sprachen: Java, Python, Perl, C, C++, oder R. Erfahrung im Umgang mit Daten aus der Hochdurchsatz-Sequenzierung sind wünschenswert. Starke kommunikative Fähigkeiten und Teamfähigkeit werden vorausgesetzt. Wir setzen sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift voraus. 

Weitere Informationen über unsere Gruppe finden Sie unter: http://www.Bio.Uni-Frankfurt.de/43045195/AK-Ebersberger 

Bitte richten Sie Ihre Bewerbung zusammen mit einem Motivationsschreiben, Ihrem Lebenslauf und den üblichen Unterlagen (einschließlich 2 Empfehlungsschreiben) bis zum 17.07.2018 in elektronischer Form (PDF) an Prof. Dr. Ingo Ebersberger, Institut für Zellbiologie und Neurowissenschaften, Abt. für angewandte Bioinformatik, Max-von-Laue-Straße 13, 60438 Frankfurt am Main, E-Mail: haenel@bio.uni-frankfurt.de.

The Department for Applied Bioinformatics in the Institute for Cell Biology and Neuroscience, faculty for biosciences, Goethe-university Frankfurt, is looking for one highly motivated 

PhD Student
(E13 TV-G-U, half-time) 

to complement its research staff. The position will be available initially for three years with the option of extension, starting at the soonest possible starting date. 

The Team: The Applied Bioinformatics Group is interested in topics circling around the evolution of biological sequences and of their functions. Thematically, we cover a broad spectrum that ranges from the modelling of sequence evolution, via the development of algorithms and methods applied in the homology search and the reconstruction of sequence and species tree, up to comparative genomics and the functional annotation transfer between sequences from model- and non-model organisms. Our overarching aim to reconstruct how functional protein interaction networks evolve and how this relates to the characteristics of contemporary species. We perform analyses using data from various taxonomic groups spread across the three domains of life (Bacteria, Archaea, Eukaryotes). 

The Position: We are looking for motivated people with a general interest in biological sequence analysis. Depending on the background of the candidate, possible research topics come from the areas of statistical modelling, algorithms and software development, and/or the applied analysis of x-omics data. You are invited to contribute to already ongoing projects, but we highly welcome ideas that lead to the joint design of new research topics. To complement your research activities, you will participate in the undergraduate and graduate teaching (2SWS). This will give you the chance to recruit students to support you in your research project.

There is room for independent research, especially working on a doctoral thesis. 

What we expect: You have at least a university degree (MSc. or equivalent) in Bioinformatics, Computer Science, Molecular-/Systems-Biology, Mathematics/Statistics, Physics, or a related field. We expect very good programming skills in at least one of the following languages: Java, Python, Perl, C, C++, or R. Experiences in the handling and analysis of high throughput sequencing data is a plus. We expect strong communication skills and the ability to work in a team. Very good knowledge in written and spoken English are a pre-requisite. 

You will find further details about our group at http://www.Bio.Uni-Frankfurt.de/43045195/AK-Ebersberger 

Please direct your application together with a motivation letter, your CV, and the usual documents (including to letters of recommendation) as a PDF file until July 3^rd 2018 to Prof. Dr. Ingo Ebersberger, Institut für Zellbiologie und Neurowissenschaften, Abt. für Angewandte Bioinformatik, Max-von-Laue-Straße 13, 60438 Frankfurt am Main, e-Mail: haenel@bio.uni-frankfurt.de. 

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Am Institut für Zellbiologie und Neurowissenschaft, in der Abteilung für Angewandte Bioinformatik, des Fachbereichs Biowissenschaften der Goethe-Universität Frankfurt ist die Stelle einer/eines

Wissenschaftlichen Mitarbeiterin/Mitarbeiters
(E13 TV-G-U, halbtags) 

zum nächstmöglichen Zeitpunkt zu besetzen. Die Stelle ist für 3 Jahre mit der Möglichkeit auf Verlängerung zu besetzen. 

Der Arbeitskreis für Angewandte Bioinformatik beschäftigt sich mit Forschungsthemen rund um die Evolution von biologischen Sequenzen und deren Funktion. Hierbei decken wir ein breites Spektrum ab, das von der Modellierung von Sequenzevolution, über die Entwicklung von Algorithmen und Methoden in der Homologen-Suche und die Rekonstruktion von Sequenz- und Speziesbäumen bis hin zu vergleichenden Genomanalysen und dem funktionellen Annotationstransfer zwischen Modell- und nicht-Modell-Organismen reicht. Unser übergeordnetes Ziel ist es, die Evolution von funktionellen Protein-Interaktionsnetzwerken zu rekonstruieren und mit den Charakteristika der heute existierenden Arten zu verbinden. Wir führen diese Analysen anhand von Daten unterschiedlicher Organismengruppen durch, die sich aus allen drei Domänen des Lebens (Bakterien, Archaea, Eukaryoten) rekrutieren.

 Wir suchen für die Erweiterung unserer Gruppe eine motivierte Persönlichkeit mit einem Interessensschwerpunkt in der biologischen Sequenzanalyse. Mögliche Arbeitsthemen können sich, je nach Vorbildung, aus dem Bereich der statistischen Modellierung, der Algorithmen- und Software-Entwicklung, und/oder aus der angewandten bioinformatischen Analyse von x-omics Daten rekrutieren. Sie haben die Möglichkeit, zu laufenden Projekten beizutragen, die gemeinsame Entwicklung neuer Forschungsthemen ist jedoch ausdrücklich erwünscht. Im Rahmen einer Beteiligung an der Lehre in einer Höhe von 2 LVS haben Sie die Möglichkeit Lehrerfahrung zu sammeln und Studierende für Ihr Forschungsprojekt zu begeistern. Es wird Gelegenheit zu selbstbestimmter Forschung gegeben. 

Voraussetzungen: Sie haben mindestens ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (MSc. oder vergleichbar) in Bioinformatik, Informatik, Molekular-/Systembiologie, Mathematik/Statistik, Physik oder in einem verwandten Feld. Wir erwarten sehr gute Programmierkenntnisse in mindestens einer der folgenden Sprachen: Java, Python, Perl, C, C++, oder R. Erfahrung im Umgang mit Daten aus der Hochdurchsatz-Sequenzierung sind wünschenswert. Starke kommunikative Fähigkeiten und Teamfähigkeit werden vorausgesetzt. Wir setzen sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift voraus. 

Weitere Informationen über unsere Gruppe finden Sie unter http://www.Bio.Uni-Frankfurt.de/43045195/AK-Ebersberger 

Bitte richten Sie Ihre Bewerbung zusammen mit einem Motivationsschreiben, Ihrem Lebenslauf und den üblichen Unterlagen (einschließlich 2 Empfehlungsschreiben) bis zum 03.07.2018 in elektronischer Form (PDF) an Prof. Dr. Ingo Ebersberger, Institut für Zellbiologie und Neurowissenschaften, Abt. für Angewandte Bioinformatik, Max-von-Laue-Straße 13, 60438 Frankfurt am Main, E-Mail: haenel@bio.uni-frankfurt.de.